本站讯(记者 朱宝琳 通讯员 金舟) “做研究离不开高性能计算,个人计算机已经很难满足科研计算要求,而集群购置与维护的不菲费用不是每个课题组都能负担得起的,天津大学超算中心真是为校内师生解决了这一难题。”12月27日下午,在天津大学超算中心用户培训与交流会上,环境学院建造环境研究室教师龙正伟如是说,他正在为手头若干科研项目和有限的计算资源而发愁,天津大学超算中心免费试用的消息犹如“天上掉下来的馅饼”,为他解了燃眉之急。

今年11月初,天津大学超算中心进入试运行阶段,其计算平台和资源在校内充分开放和共享,为学校各学院师生提供高性能计算服务。超算中心部署的曙光“星云”系列高性能计算集群包含56个计算结点,1232个CPU核,峰值速度达到每秒11万亿次,内存总容量2TB,并行存储总容量33TB,系统选用Suse Linux 11操作系统,可提供C/C++/Fortran/MPI等多种编译环境,并广泛支持各类高性能计算应用软件,集群计算能力目前在国内高校中居于前列。超算中心还作为国家超级计算天津中心天津大学分中心,实现与“天河一号”超级计算机系统的连接,从而满足具有超大规模计算任务用户的计算需求。
试运行以来,已有精仪、电信、自动化、建工、化工、材料、管理与经济学部、理学院、计算机、软件、环境、药学院、内燃机研究所等13个学院(单位)五十余位用户申请计算集群使用账户,用户课题涵盖科学计算、生物信息、工程仿真等多个领域。超算中心已累计为用户分配计算资源2694个CPU核次,存储使用超过3.2 TB,用户总在线时长超过11500小时,各计算节点基本处于满负荷运行状态,多个计算任务已经取得阶段性成果。超算中心作为学校公共服务基础设施之一,其所提供的高性能计算在教学科研中的作用初步显现。
在本次以“触手可及的高性能计算”为主题的培训与交流会上,校资产处副处长贺强首先介绍了学校建设超算中心的初衷与目的,并对超算中心在较短时间内克服各种困难基本完成系统部署与调试,及早地为用户提供计算服务表示了肯定。超算中心工作人员在会上介绍了试运行以来的总体情况,用户服务流程和计算集群使用方法。来自校内多个课题组的老师和学生在会上介绍了利用超算中心计算集群所做科研工作及取得的成果,分享应用心得。理学院化学系何学浩教授课题组的博士生杜波以所从事的“序列与双硫键共同影响下的蛋白质热力学转变问题”研究工作为例,对比了超算中心计算集群和他所在课题组现有小规模集群的计算能力。在相同线程数条件下,无论是单线程还是多线程的并行计算,超算中心集群计算耗时都更少,尤其对于超大规模的算例,这种提速效果更为明显。来自天津大学生物信息中心的教师高峰介绍了“大规模RNA-seq数据分析”计算任务的执行情况,通过使用超算中心的计算集群,完成一次数据分析的时间,从原来的长达一周缩短到仅需4个小时。高峰还对超算中心工程师专业的技术支持表示了感谢,并相信超算中心秉承这种为大家服务的精神会逐渐成为全校师生科研工作必不可少的平台。
本次培训与交流会得到了用户的积极关注,会场座无虚席,到场听众人数大大超过预期,很多用户都是站着听完所有培训内容。现场互动交流气氛热烈,活动结束后仍有很多用户没有离开,向超算中心技术工程师咨询计算集群使用相关问题。超算中心所受关注从一个侧面说明我校科研水平的不断提高,各课题组高性能计算需求日益增多。通过超算中心这一平台为全校师生提供公共计算服务,提高了计算效率,提升科研数据处理与分析的精度和可信度,有效促进科研工作进展,为我校科研发展与持续创新提供有力保障。
据悉,在新的一年里,超算中心将进一步完善机时分配制度,通过启用作业调度管理系统,提高计算节点利用率,充分发挥集群的计算潜力,缓解目前计算资源日益紧张的状况。位于第十二教学楼的用户服务中心将在2012年1月1日投入使用,服务中心设有用户操作区和培训交流区,将为计算用户提供更为周到和全面的技术支持服务。超算中心网站(http://hpcc.tju.edu.cn)也将在同日上线并投入试运行,用户可从网站下载各种参考资料,并在线完成开户申请、机时预定等业务的办理。