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天津大学生命科学学院王亚鑫、叶升团队揭示了伪狂犬病毒dUTPase结构和催化机制

      2024-09-22       

本站讯(生命科学学院供稿)伪狂犬病病毒(PRV)是猪疱疹病毒科Alpha疱疹病毒亚家族的一员,是一种包膜双链DNA病毒。这种病毒是Aujeszky病的病原体,自然界中猪是PRV的主要宿主,在5日龄以内的仔猪中,PRV感染的死亡率约为100 %,对养猪业造成了沉重的损失。作为PRV的关键酶,dUTPase的功能是维持较低的细胞dUTP/dTTP比率,确保DNA复制的准确性,并通过催化dUTP水解成dUMP和焦磷酸盐来为dTTP提供dUMP前体,但其结构和酶催化机制尚不清晰。

2024年9月17日,天津大学生命科学学院王亚鑫、叶升团队在International Journal of Biological Macromolecules(一区TOP)上在线发表题为“Structural definition of pseudorabies virus dUTPase reveals a novel folding dimer in the herpesvirus family”的研究论文。

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首先,团队通过X射线衍射解析了伪狂犬病毒dUTPase的2.23 Å高分辨晶体结构,阐明dUTPase以果冻卷基序形成的β桶二聚体的形式存在,两种单体的结构表现出高度的相似性,但在它们的二级结构中可以观察到细微的差异。利用静态光散射和小角衍射分析,证实了二聚体在溶液中的稳定性。同时根据其结构信息,在每个单体中存在一个空腔,根据空腔的结构及其与底物dUMP的相互作用,可以合理地将其视为PRV dUTP酶的活性中心(图1)。

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图1.伪狂犬病毒dUTPase的晶体结构。

在伪狂犬病毒和其他物种的dUTPase序列比对中,发现与三聚体dUTP酶相比,PRV dUTP酶没有表现出明显的保守基序。而在伪狂犬病毒和其他疱疹病毒的dUTPase序列比对中,发现这些dUTP酶之间的序列具有6个明显保守的基序。针对这些保守基序上的结合底物的关键氨基酸进行了突变,并检测dUTPase突变体的酶活性,G82A、V84A、F88A和Q93A突变体的酶活性不受明显影响,相反,I83A、D85A、D173A、R172A、S173A、S174A和Q214A突变体的酶活性显著降低(图2)。

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图2.突变体dUTPase酶活性测定。

与已发现的疱疹病毒家族中单体dUTPase不同,伪狂犬病毒dUTPase以稳定的二聚体形式存在。为了探究二聚体的寡聚状态对dUTPase的作用,团队对二聚体互作界面进行分析,发现与dUTP酶的经典二聚体状态(例如克氏锥虫和重型利什曼原虫)不同,它们利用α螺旋和非二级结构之间的相互作用缠结以构成二聚体界面,而PRV dUTP酶在很大程度上依赖于在四个β折叠片的N端残基P33-V36和C端残基R242-A248之间建立的氢键和疏水相互作用网络。破坏这些残基之间的氢键网络,对酶活性产生了很大影响,热迁移试验(TSA)还表明二聚体互作界面对蛋白稳定发挥了关键作用(图3)。

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综上所述,该研究发现了疱疹病毒家族中一种全新的dUTPase结构,并为基于结构的药物开发提供了研究基础。天津大学生命科学学院硕士研究生李嘉辰、博士生马森、杨润泽为本文的共同第一作者,天津大学王亚鑫副教授和叶升教授为本文的共同通讯作者,天津大学生命科学学院为本文第一单位,该研究得到科技部重点研发计划、国家自然科学基金的资助。

文章链接:https://doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2024.135696

(编辑 焦德芳 王淑敏)